В генетический алфавит добавили четыре новые буквы. К «естественным» А, Т, Г, Ц добавились З, Б, С, П — Наука
В классическом «алфавите», которым написана наша ДНК, — четыре нуклеотида: аденин (А), гуанин (Г), цитозин (Ц) и тимин (Т). В алфавите РНК символов больше: кроме урацила (У), заменяющего тимин, там встречаются неканонические нуклеотиды, но они появляются там после копирования, в результате дополнительных модификаций. Это, в частности, может означать, что ДНК-нуклеотидов тоже могло быть больше, если бы возникновение жизни пошло другим путем.
Предыдущие исследования показали, что нуклеотиды в составе ДНК не обязательно должны образовывать связи с противоположной цепью. Для устойчивости структуры достаточно, чтобы все пары нуклеотидов были одинакового размера, а связи между ними не имеют большого значения. Благодаря этому удалось увеличить генетический алфавит на два нуклеотида. Но если длинные участки ДНК состоят из таких не связанных между собой нуклеотидов, то цепи будут скользить друг относительно друга.
Поэтому, чтобы сделать молекулу прочнее, новые буквы должны образовывать водородные связи подобно классическим парам.
Группа американских ученых смогла добавить в генетический алфавит четыре новых нуклеотида, о чем они сообщают в новом выпуске Science. Новые «буквы» являются производными классических нуклеотидов и зовутся З, Б, С и П. Они также образуют между собой комплементарные пары: З с П, а Б с С. Получившийся алфавит исследователи назвали японским словом «хатимодзи», что в переводе означает «восемь букв».
Восьмибуквенные молекулы хатимодзи-ДНК оказались похожи на классическую двойную спираль и по кристаллической структуре, и по устойчивости, и по температуре плавления (разъединения цепей). Более того, на базе такой ДНК удалось построить соответствующую РНК-копию, то есть природные ферменты легко подхватывают новые «буквы» и встраивают их в цепь.
Ученые также подтвердили, что новые нуклеотиды не встраиваются в РНК случайным образом, построив из хатимодзи-РНК аптамер — сложную структуру, которая умеет связывать другие вещества.
Тестовый аптамер связался со светящимся белком и засветился сам. Это говорит о точности копирования ДНК: если бы при построении ДНК нуклеотиды встраивались в цепь случайно, структура РНК не сформировалась бы и не смогла бы удержать краситель.
Расширение генетического алфавита не говорит нам ничего о прошлом ДНК, кроме того, что на месте АТГЦ могли бы быть другие буквы, зато значит немало для ее будущего. Нетрудно подсчитать, что восьмибуквенный код гораздо более емкий, чем четырехбуквенный. Поэтому, например, развивающаяся технология хранения информация в ДНК может получить дополнительный импульс.
22/02 00:45 (мск): В оригинале этой заметки мы воспроизвели название, что дали исследователи «нуклеотидному алфавиту», как «хачимодзи», что неверно. На нашу ошибку нам указал наш коллега, Даниил Кузнецов. Спасибо, Даниил!
Полина Лосева
Что такое ДНК и хромосомы
Что такое ДНК, и из чего она состоит? Кто и когда открыл эту молекулу в клетках человека и других живых организмов? Чем уникален открытый учеными механизм наследования, и какие последствия ждал весь мир после этого открытия? Всю необходимую информацию Вы можете узнать, прочитав эту статью.
Иоганнес Фридрих Фишер – врач и биолог-исследователь родом из Швейцарии, стал первым в мире ученым, выделившим нуклеиновую кислоту. Открытие случилось в 1869 году, когда он занимался изучением животных клеток, а именно лейкоцитов, которых много содержалось в гное. Совершенно случайно молодой ученый заметил, что при отмывании лейкоцитов с гнойных повязок от них остается загадочное соединение. Под микроскопом Иоганн обнаружил, что оно содержится в ядрах клеток. Это соединение Мишер назвал нуклеином, а в процессе изучения его свойств переименовал в нуклеиновую кислоту, из-за наличия свойств, как у кислот.
Роль и функции только открытой нуклеиновой кислоты были неизвестны. Однако многие ученые того времени уже высказывали свои теории и предположения о существовании механизмов наследования.
Нынешние взгляды на состав молекулы ДНК ассоциируются у людей с именами английских ученых Джорджа Уотсона и Фрэнсиса Крика, которые открыли структуру данной молекулы в 1953 году.
За несколько лет до этого, в тридцатые годы, ученые из советского союза А.Н. Белозерский и А.Р. Кезеля доказали наличие ДНК в клетках во всех живых организмах, тем самым они опровергли теорию о том, что молекула ДНК находится только в клетках животных, а в клетках растений присутствует только РНК. Лишь спустя несколько лет, в 1944 году, группой освальдских ученых было установлено, что молекула ДНК является механизмом сохранения наследственной информации клетки. Таким образом, благодаря совместным усилиям и трудам исследователей человечество познало тайну процесса эволюции и его основных принципов.
Открытие состава молекулы дезоксирибонуклеиновой кислоты позволило перейти медицине на новый уровень развития. Появилось большое количество новых направлений практической медицины, стали доступны новые методы лечения, диагностики. Благодаря этому фундаментальному открытию для науки и современным технологиям, человечеству стали доступны:
- Возможность поставить диагноз на ранней стадии заболевания, когда оно еще находится в скрытом периоде, и никаких симптомов не проявляется.
- Тест ДНК на установление родственных связей у человека.
- Тесты на наличие у человека аллергии или непереносимости некоторых пищевых продуктов. Индивидуальные исследования помогут выявить, какая пища хорошо усваивается организмом, а какая плохо или вообще не усваивается, и что может стать причиной аллергической реакции у исследуемого.
- Анализ ДНК этнических особенностей. Возможность узнать, какие этносы формируют Вашу внешность, и из каких народов были Ваши далекие предки
- Тест на наличие врожденных заболеваний, передающиеся через поколения, оценка риска их возникновения у тестируемого человека.
И это еще не все доступные для людей услуги, которые может предложить медицина, изучающая генетику. Выше были представлены только самые популярные среди людей тесты. Перспективой для многих ученых-генетиков является создание таких лекарств, способных победить все болезни на Земле и даже смертность.
Строение молекулы ДНК
Молекула ДНК состоит из органических соединений — нуклеотидов, которые скручиваются в две спиралевидные цепи.
Нуклеотиды в этих цепях – это базовые элементы, с помощью которых потом будут кодироваться и выстраиваться гены. В составе одного гена возможны несколько вариантов расположения некоторых нуклеотидов, поэтому вместе с тем, как меняется структура гена, меняется и его функциональность.
От цепочки к хромосоме
В каждом живом организме находится миллионы клеток, а внутри этих клеток находится ядро. Клетки, содержащие в себе ядро, называются эукариотами или ядерными. У древних одноклеточных нет оформленного ядра. К таким безъядерным одноклеточным, или прокариотам, относятся бактерии и археи, например, кишечная палочка или серая анаэробная бактерия. Также ядро отсутствует в клетках вирусов и вироидов, однако причисление вирусов к живым организмам – вопрос спорный, о котором по сей день дискуссируют ученые.
В ядре находятся хромосомы – структурный элемент, в котором содержится молекула ДНК в виде спирали, хранящая внутри себя всю генетическую информацию клетки.
Процесс упаковки ДНК спиралей
Количество нуклеотидов в ДНК велико, и нужны длинные цепочки, чтобы вместить все их число, поэтому нити ДНК закручиваются в две спирали, что позволяет укоротить цепочки в 5 раз, сделав их более компактными. Нити ДНК могут также закручиваться в форму суперспирали. Двойная спираль пересекает свою ось и накручивается на специальные гистоновые белки – гиразы, образуя при этом супервитки. Таким образом, двойная спираль закручивается в спираль более высокого порядка. Сокращение цепочек в этом случае произойдет в 30 раз.
Как гены связаны с ДНК
Ген – самый изученный на сегодняшний день участок ДНК. Гены являются структурной единицей наследственности всех живых организмов. Цепочки нуклеотидов в ДНК состоят из генов, которые определяют генотип особи, например, цвет и разрез глаз, тип кожи, рост, группу и резус фактор крови и другие физиологические качества и особенности внешности.
Еще много отраслей генетики до конца не изучены, и до конца не раскрыты все функции генома, но ученые до сих пор продолжают изучение генов, чтобы добиться новых открытий в области генетики.
Хромосома: определение и описание
Хромосомы – структурный элемент клетки, находящийся внутри ядра. Они содержат в себе молекулы ДНК, в которых содержится вся наследственная информация.
Строение и виды хромосом:
Хромосома состоит из двух «палочек» — хроматид, перетянутых по центру первичной перетяжкой – центромерой. Конец хромосомы называется теломером. Центромера может делить хромосому на короткое и длинное плечо.
Отсюда возникают различные типы хромосом:
- Равноплечая – центромера перетягивает хроматиды точно посередине;
- Неравноплечая – центромера неточно перетягивает хроматиды, из-за чего одно плечо хромосомы будет длиннее, а другое – короче. К этому типу относится Y-хромосома;
- Палочковидная – центромера перетягивает хроматиды практически на их концах, из-за чего по форме хромосома напоминает палочку;
- Точковые – очень мелкие хромосомы, форму которых трудно определить. В науке существуют 3 основные формы хромосом:
- Х-хромосома, встречающаяся у особей женского и мужского пола;
- Y-хромосома, встречающаяся только у мужских особей;
- В-хромосома, которая очень редко встречается в клетках растений. Обычно их число доходит до 6, редко – до 12. Ее наличие обуславливает различные болезни и побочные эффекты в организме
Обычно их число доходит до 6, редко – до 12. Ее наличие обуславливает различные болезни и побочные эффекты в организмеВсего в клетке человека находится 46 хромосом: 22 пары аутосом, встречающиеся у обоих полов, и одна пара половых хромосом: XY – у мужчин, XX – у женщин. Забавно, что если прибавить к количеству хромосом хотя бы одну пару, то человек мог бы быть шимпанзе или тараканом, а если отнять, то – кроликом.
Еще интересно то, что человек и ясень имеют одинаковое количество хромосом, несмотря на принадлежность к разным видам и царствам.
Генетический код – система записи генетической информации в ДНК и РНК в виде определенной последовательности в цепочке нуклеотидов. Он должен сохранять наследственную информацию в первоначальном виде, восстанавливая повреждения цепочки в последующем поколении с помощью ДНК. Однако ген может каким-то образом быть поврежден, либо в нем может произойти мутация.
Генные мутации – изменение в последовательности нуклеотидов, например выпадение, замена, вставка другого нуклеотида в цепочку.
Последствия этих мутаций могут быть полезные, вредные или нейтральные. Примером полезных мутаций является устойчивость к минусовым температурам, увеличенная плотность костей, меньшая потребность во сне, устойчивость к ВИЧ и другие. Примером вредных мутаций является аллергия на солнечный свет, глухота слепота и так далее. К нейтральным мутациям относятся те мутации, которые не влияют на жизнеспособность, например, гетерохромия.
Существуют также летальные и полулетальные мутации. Летальные мутации несовместимы с жизнью и приводят к гибели организма на ранних этапах его развития, например, при рождении у особи отсутствует головной мозг. Полулетальные мутации не приводят к смерти особи, но значительно уменьшают ее жизнеспособность. К таким мутациям относятся заболевания человека, передающиеся по наследству. Например, наличие 47-й хромосомы может вызвать у человека синдром Дауна, а, наоборот, отсутствие 46-й парной хромосомы – сидром Шерешевского-Тернера.
Расшифровка цепочки ДНК
Расшифровка цепочки ДНК в клетке – это исследование всех известных генов в клетках человека.
Хоть цена за такую услугу значительно упала за последние десять лет, однако такое исследование по-прежнему остается дорогим удовольствием, и не каждый человек сможет позволить себе оплатить такую услугу. Чтобы уменьшить цену этого исследования, расшифровку ДНК стали делить по тематикам. Таким образом, появились различные тесты, которые исследуют интересующую человека группу генов и ее функции.
Как происходит расшифровка цепочки ДНК?
- Взятые на пробу образцы ДНК нагревают, чтобы двойная спираль раскрутилась и распалась на две нити.
- К интересующему участку цепочки генов прилепляется полимераза — фермент, синтезирующий полимеры нуклеиновых кислот. Процедура проходит при низких температурах.
- С помощью полимеразы в интересующих участков происходит синтезов генов, необходимых для изучения.
- Участки пропитывают светящейся краской, которая светится при лазерном воздействии.
Таким образом, ученые получают картину гена, которую можно изучить и расшифровать.
Синтез РНК Нуклеотиды делятся на четыре базовых элемента, служащими основой для формирования генов: АТГЦ, или аденин, тимин, гуанин, цитозин. В их состав входят фосфорные остатки, азотистые основания и пептоза.
В ДНК эти нуклеотиды располагаются строго по парам параллельно друг другу строгими парами: аденин — с тимином, гуанин — с цитозином.
Важно, что молекула дезоксирибонуклеиновой кислоты не должна выходить за пределы мембраны ядра. С помощью РНК, которая играет роль копии участка цепи с генетическим кодом, генетическая цепочка может покинуть ядро, попасть вовнутрь клетки и воздействовать на ее внутренние процессы.
Как это происходит:
- Один конец генной спирали раскручивается, формируя две развернутые нити с цепочкой генов.
- К развернутому участку спирали подходит специальный фермент-строитель и поверх этого участка синтезирует его копию.
- У копии в структуре нуклеотидов тимин во всех парах заменяется на урацил, что позволяет копии генетической цепи покинуть ядро клетки. Синтез белка при помощи генов Основное взаимодействие, происходящее между генами и клеткой, состоит в том, что различные гены могут заставлять клетку производить синтез разных белков с самыми непредсказуемыми свойствами.
Синтез белка при помощи генов Основное взаимодействие, происходящее между генами и клеткой, состоит в том, что различные гены могут заставлять клетку производить синтез разных белков с самыми непредсказуемыми свойствами.Итак, группа генов, участвующих в процессе старения клеток может, как заставить процесс старения идти быстрее, так и вовсе его остановить и запустить процесс омолаживания. То есть, каждый из генов может спровоцировать синтез нескольких видов белка.
Сутягина Дарья Сергеевна
Эксперт-генетик
В нашей ДНК содержится очень много информации, но пока мы можем расшифровать лишь небольшой процент генов. Добавлю несколько интересных фактов о ДНК: возможность двойной ДНК у человека. Такое явление случается, когда при беременности в утробе развиваются близнецы, но в процессе развития плода они сливаются в одного человека. Длина одной молекулы ДНК человека равна 2 метрам, а общая длина цепочки ДНК всех клеток тела человека равна 16 млрд.
километрам, что равно расстоянию от Земли до Плутона. ДНК человека и кенгуру всего лишь 150 млн. лет назад были одинаковыми. Все знания и информация во всем мире могла бы уместиться всего лишь в 2 граммах дезоксирибонуклеиновой кислоты.синтетических ДНК останутся
Опубликовано 23 ноября 2018 г. Джейн Уильямс
Одним из самых удивительных аспектов, окружающих нас, является сама жизнь — не только люди, но и окружающая среда: деревья, цветы, насекомые, животные и даже бактерии. Все они имеют одну центральную молекулу, которая имеет решающее значение для их существования.
Биотехнологическая промышленность: в начале
Новая эра началась, когда в 1952 году Альфред Херши и Марта Чейз провели эксперимент, известный сегодня как эксперимент с блендером Херши-Чейза. Используя радиоактивно меченый белок и ДНК, они доказали, что молекула ДНК ответственна за нашу наследственность. В 1953 Джеймс Уотсон и Фрэнсис Крик открыли структуру ДНК.
Вскоре после их открытия в апреле 1953 года всемирно известный физик Нильс Бор написал Максу Дельбрюку, что «в биологии происходят очень замечательные вещи».
Открытие Джеймса Уотсона могло соперничать с открытием Резерфордом атомного ядра в 1911 году. Резерфорд известен как «отец ядерной физики», а Дельбрюк сыграл важную роль в запуске исследований в области молекулярной биологии. Примерно двадцать лет спустя начали появляться новые методы, и ДНК сыграла решающую роль, когда начала формироваться индустрия биотехнологий. Но только в 2003 году была полностью определена последовательность нуклеотидов ДНК человека.
Генетическая информация
Иногда называемая самой важной молекулой, геномная информация кодируется ДНК. Эта информация копируется из поколения в поколение. Удивительно, но эта молекула содержит всю генетическую информацию, необходимую для построения организма. Кроме того, если вы проследите свое генеалогическое древо достаточно далеко, вы обнаружите, что вы связаны родственными узами с белками в вашем саду и даже с плесенью в вашем хлебе.
Все эти организмы используют для размножения одну и ту же универсальную генетическую информационную систему. Информация, хранящаяся в ДНК, транскрибируется через молекулы РНК в белки, и этот каскад событий называется «центральной догмой биологии». Белки, с другой стороны, заботятся практически обо всех функциях наших клеток, от метаболизма лекарств до регуляции сердцебиения. Линейный порядок нуклеотидов в ДНК определяет состав белков; следовательно, единственное изменение в последовательности ДНК может привести к изменению структуры и функции белка.
Структура ДНК
ДНК представляет собой двухцепочечный спиральный полимер, а скрученная лестничная структура придает молекуле стабильность. Фактическое кодирование информации основано на порядке расположения четырех нуклеотидов в двойной спирали: аденозина (А), гуанина (G), тимидина (Т) и цитозина (С).
В полной спирали ДНК аденозин всегда спаривается с тимидином противоположной цепи. Аналогичным образом цитозин связывается только с гуаниновыми нуклеотидами. Таким образом, изменение любого из этих оснований на любое другое, кроме традиционных генетических алфавитов A, T, C или G, вероятно, повлияет на стабильность и структуру ДНК и может превратить ее в нефункциональную, нестабильную молекулу, подобную лестнице.
В закрученной спирали ДНК гуанин связан тремя водородными связями с цитозином, а аденин — двумя с тимином. Эти два правила комплементарности имеют решающее значение для структуры и функции ДНК: комплементарность размеров (большие пары пуринов T и C с небольшими пиримидинами A и G) и комплементарность связей атомов водорода. На самом деле в природе существуют три разные версии ДНК, но наиболее распространена так называемая В-ДНК. Эта молекула правосторонняя и имеет примерно 10 пар нуклеотидов, либо A-T, либо G-C на один виток. Эта конструкция сохранилась на протяжении миллионов лет эволюции, поэтому она явно должна быть оптимальной для своего назначения.
Зачем нам это менять? Возможно, для создания новых форм жизни или хотя бы новых белков для производства уникальных продуктов, которые будут использоваться в медицине? Однако подобные манипуляции сопряжены с риском, если эти новые формы жизни или модификации будут выпущены из лаборатории даже в результате непредвиденной аварии. Таким образом, в худшем случае они могут начать размножаться в нашей среде с неизвестными последствиями. Чтобы предотвратить это, наиболее логичным подходом, возможно, является модификация или «взлом» ДНК для использования нуклеотидов, недоступных в природе. Они также известны как неестественные пары оснований (UBP).
Где мы сейчас?
Эксперименты с UBP и искусственными генетическими системами начались почти 30 лет назад. В 1990 году исследовательская группа Стивена Беннера опубликовала статью, описывающую новую пару оснований Уотсона-Крика с альтернативным рисунком водородных связей. Вскоре эта область привлекла внимание научной прессы, и в 2000 году в престижном журнале Science появилась статья под названием «Creation’s Seventh Day», в которой описывались усилия ученых Исследовательского института Скриппса под руководством профессора Ромесберга.
Перенесемся в 2008 год. Исследовательская группа Ромесберга опубликовала несколько важных отчетов о ходе работы. Первый из них описал свою работу по поиску новых не встречающихся в природе пар нуклеотидов, а именно d5SICS:dMMO2. Их характеристика этих UBP предполагает, что синтез и удлинение были как эффективными, так и селективными. Эти свойства имеют решающее значение, поскольку ДНК используется в качестве матрицы, когда клетки делятся, и ДНК копируется для новых дочерних клеток. Они опубликовали больше статей по этому вопросу и показали, что ДНК, содержащая эти синтетические аналоги, может быть амплифицирована с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР) — метода, который стал одним из важнейших краеугольных камней в развитии современной биотехнологии.
Вскоре после этого группа Беннера из Гейнсвилля, штат Флорида, продемонстрировала успешную амплификацию последовательностей ДНК, содержащих шестибуквенную синтетическую генетическую систему, которую они назвали AEGIS.
Они продемонстрировали, что синтетические нуклеотиды не теряются, когда ДНК копируется и амплифицируется ДНК-полимеразами. Это снова является важным соображением, поскольку мог быть естественный уклон в сторону четырехбуквенной системы, проверенный и проверенный эволюцией. Кроме того, они также показали, что частота мутаций была низкой, 0,2% за теоретический цикл. Этой низкой частоты мутаций достаточно, чтобы сделать возможным дарвиновскую эволюцию, но достаточно низкой, чтобы не вызвать катастрофической нестабильности генома. Эта новая генетическая система, по-видимому, ведет себя как обычные геномы, встречающиеся в природе.
В 2014 году Денис Малышев из исследовательской группы Ромесберга опубликовал статью, в которой описал первую бактерию, которая стабильно размножается «расширенным генетическим алфавитом», используя неестественные пары оснований d5SICS и dNaM. Эти неестественные основания не удалялись и не репарировались естественными путями репарации ДНК, присутствующими в клетке.
В феврале 2017 года последняя публикация Ромесберга для Proceedings of the National Academy of Sciences вызвала большой интерес, поскольку его группа сообщила об оптимизации систем, избежав ограничений их первой попытки.
Со времен последнего общего предка жизни на Земле биологическая информация кодировалась четырьмя нуклеотидами, образующими две комплементарные пары оснований. Прошло более 50 лет с тех пор, как Алекс Рич впервые предложил разработку UBP, и 25 лет с тех пор, как лаборатория Стива Беннера произвела первых жизнеспособных кандидатов. Новые синтетически созданные формы жизни имеют большие перспективы в области биотехнологии, медицины, охраны окружающей среды и промышленности. Цена медицинских и фармацевтических решений может быть значительно снижена с использованием этих новых организмов, и это частично из-за экономии времени.
Экономия времени
Вместо того, чтобы разрабатывать эти новые решения годами, на создание этих новых решений может уйти всего 24 часа. Однако, как и генетически модифицированные организмы (ГМО) в последние десятилетия, они могут нести потенциальную угрозу, если их гены бесконтрольно ускользнут в естественную среду.
Этические проблемы будут проблемой с полусинтетическими организмами, некоторые критики уже говорят, что ученые играют в Бога. Должно потребоваться очень строгое регулирование, но предотвратит ли оно возможное неправильное использование этой технологии?
Одним из опасений является возможность создания нового биологического оружия и патогенов, которые могут оказаться в руках биотеррористов. Поскольку они разработаны с использованием компьютера, некоторые эксперты по этике задаются вопросом, в чем разница между живым организмом и машиной. Мы уже несколько десятилетий используем клетки млекопитающих для производства антител и вакцин для спасения жизней людей. Для исследования рака мы выращивали клеточные линии человека, полученные от отдельных индивидуумов.
Эти люди-доноры с тех пор умерли, так являются ли эти живые клетки организмами или машинами? У них есть полная генетическая информация о донорах. В природе постоянно происходят эволюция и мутации. Каким бы ни был ответ, мы вступаем в новую эру биотехнологии.
Если эти риски держать под контролем, у нас может быть новый, очень мощный инструмент для разработки новых белков для терапии, вакцин, биотоплива и даже новых устройств или материалов.
Яри Лухелайнен — адъюнкт-профессор биохимии Хельсинкского университета. Он представит свою презентацию «Оценка ингибиторов ПЦР/КПЦР с эффектом различных полимераз и методов экстракции: не все подходы одинаковы» на саммите 4BIO: Европа.
Саммит 4BIO: Европа пройдет 27 и 28 ноября в Роттердаме. У вас остается мало времени, чтобы гарантировать себе место — бронируйте сейчас, чтобы не разочароваться.
Метки: ДНК, ГМО, нуклеотиды, ПЦР, РНК
Оставить комментарий
Молекулярные массы ДНК и РНК и преобразование | Термо Фишер Сайентифик
Молекулярные массы нуклеотидов
See our nucleic acid isolation and analysis products
| Nucleotide | MW (g/mol) |
|---|---|
Ribonucleotide Triphosphates (Avg. MW = 499.5) | |
| ATP | 507.2 |
| CTP | 483.2 |
| GTP | 523.2 |
| UTP | 484.2 |
| Ribonucleotide Monophosphates (Avg. MW = 339.5) | |
| AMP | 347.2 |
| CMP | 323.2 |
| GMP | 363.2 |
| UMP | 324.2 |
| Deoxyribonucleotide triphosphates (Avg. MW = 487.0) | |
| dATP | 491.2 |
| dCTP | 467.2 |
| dGTP | 507.2 |
| dTTP | 482.2 |
| Deoxyribonucleotide Monophosphates (Avg . MW = 327.0) | |
| dAMP | 331.2 |
| dCMP | 307. 2 |
| dGMP | 347.2 |
| dTMP | 322,2 |
Преобразование молекулярной массы нуклеиновой кислоты
Точная молекулярная масса одноцепочечной РНК (например, транскрипт РНК):
M.W. = (An x 329,2) + (Un x 306,2) + (Cn x 305,2) + (Gn x 345,2) + 159ª и Gn представляют собой количество каждого соответствующего нуклеотида в полинуклеотиде. Рассчитанное значение M.W.
действительно при физиологическом pH.
ªДобавление «159» к молекулярной массе учитывает молекулярную массу 5′-трифосфата.
Точная молекулярная масса одноцепочечной ДНК (например, олигонуклеотидов):
M.W. = (An x 313,2) + (Tn x 304,2) + (Cn x 289,2) + (Gn x 329,2) + 79,0ª
An, Tn, Cn и Gn представляют собой количество каждого соответствующего нуклеотида в полинуклеотиде.
ªДобавление «79,0» к молекулярной массе учитывает 5′-монофосфат, оставляемый большинством рестрикционных ферментов.
Фосфат отсутствует на 5′-конце нити, полученной удлинением праймера.
Приблизительная молекулярная масса нуклеиновых кислот:
молекулярная масса одноцепочечной РНК = (количество нуклеотидов x 320,5) + 159.0
M.W. оцДНК = (# нуклеотидов x 303,7) + 79,0
M.W.дцДНК = (# нуклеотидов x 607,4) + 157,9
Преобразование размера и массы одноцепочечной РНК
| Size (nt) | Daltons or g/mol | 1 µg equivalent | |
|---|---|---|---|
| pmol | molecules | ||
| 20 | 6,569 | 152.23 | 9.17 x 10 13 |
| 100 | 32 209 | 31,05 | 1.87 x 10 13 |
| 300 | 96,309 | 10.38 | 6.25 x 10 12 |
| 500 | 160,409 | 6. 23 | 3.75 x 10 12 |
| 1000 | 320,659 | 3.12 | 1.88 x 10 12 |
| 1800 | 577,059 | 1.73 | 1.04 x 10 12 |
Преобразование размера и массы оцДНК
| Size (nt) | Daltons or g/mol | 1 µg equivalent | |
|---|---|---|---|
| pmol | molecules | ||
| 20 | 6,153 | 162.52 | 9.79 x 10 13 |
| 100 | 30,449 | 32.84 | 1.98 x 10 13 |
| 300 | 91,189 | 10.97 | 6.6 x 10 12 |
| 500 | 151,929 | 6.58 | 3.96 x 10 12 |
| 1000 | 303,779 | 3. 29 | 1.98 x 10 12 |
| 1800 | 546 739 | 1,83 | 1,1 x 10 12 |
Leave A Comment